La semFYC inició los pasos para su constitución en 1982, como evolución del activo movimiento asambleario de la coordinadora de médicos residentes de Medicina de Familia y Comunitaria, que llevaba funcionado desde 1979, año en el que inició su formación la primera promoción de médicos residentes de la especialidad. Dicha evolución se produjo al ser el colectivo consciente de que se hacía necesario el mantenimiento de foros de contacto y discusión de las sucesivas promociones de especialistas en Medicina de Familia y Comunitaria.

Planteada y asumida formalmente por la asamblea del colectivo MIR de Medicina de Familia y Comunitaria, la conveniencia de constituir la semFYC se planteó en el transcurso de la larga huelga y encierro mantenida por dicho colectivo en junio de 1982. La reivindicación principal era la creación de centros de salud. Se constituyó una primera Junta Gestora, presidida por el Dr. Julio Sánchez Salvador que no logró culminar la constitución de la Sociedad ante las discrepancias surgidas en cuanto a la estructura que debía poseer dicha Sociedad.

En diciembre de 1983, en el transcurso del congreso anual celebrado aquel año en Granada, se constituye una nueva Junta Gestora, presidida por la Dra. Asunción Prieto Orzanco. Esta nueva Junta Gestora consigue finalmente la constitución formal y legal de la semFYC, con la aprobación de los Estatutos y celebración de las primeras elecciones en 1984. En éstas, la Dra. Prieto Orzanco es elegida como primera presidenta de la semFYC. La Sociedad adopta entonces, una estructura transitoria de carácter no federal aunque con amplia autonomía de actuación para las distintas Sociedades Federadas que quedaría culminado al legalizarse la totalidad de las Sociedades Autonómicas.

Durante el período de 1984 a 1987, se constituyen progresivamente la mayor parte de las Sociedades Autonómicas, contando la semFYC con 2000 socios al cumplirse los tres primeros años de su funcionamiento. Este período inicial se centró básicamente en el desarrollo estructural de la propia Sociedad y en la promoción de actividades formativas propias de las Sociedades Autonómicas. Simultáneamente a este desarrollo interno, se mantuvo una intensa actividad de evaluación de los progresos que, respecto a la creación, infraestructura y funcionamiento de los centros de salud, se vino produciendo en estos años. En esta etapa se establecen también los primeros contactos de proyección internacional de la semFYC, tanto con las organizaciones internacionales de Medicina de Familia (WONCA y CIMF), como con las Sociedades Científicas de la especialidad de otros países (Royal College Of General Practitioners y la Associaçao Portuguesa dos Médicos de Clínica Geral).

Desde entonces, la semFYC se ha ido consolidando hasta convertirse en la sociedad científica líder en el mundo sanitario y referente de la Medicina de Familia y la Atención Primaria, plasmado en una copiosa oferta en forma de publicaciones, programas, cursos y actividades de las que se benefician un creciente número de socios.